秉綬知惠州、揚州兩府，均有德惠政聲，為清一代名吏，但他從不以功自居。在揚州時，他主動從商富集居的豪華新城住所“休園”，遷至平民所居之舊城“黃氏園”，取名其寓所為“湖上草堂”，保持愛民本色。他生活上清廉耿介，平居端樸，不倚門戶，屏謝聲色，“每食必具蔬”，并以此“藉以清吾心耳”。常說：“人生也，直即天地之性，無少回邪，行則正。”嘉慶十六年秋，他重訪惠州，邑人爭相迎接，至豐湖書院，見辟伊公祠祀己，著令撤去。

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　　嘉慶二十年夏，經友人一再敦促，秉綬啟程入京，途經揚州，舊時好友皆留其小住，客居至秋，天氣漸涼，偶感霜露，猝得肺疾，于九月十一日病逝于揚州，終年62歲，歸葬寧化曹坊石牛驛(今上曹村)。秉綬逝世不到一個月，揚州士民就將他供奉于“三賢祠”內，與揚州歷史上三位名賢太守歐陽修、蘇軾、王士禎并祀。

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　　秉綬愛好廣泛，繪畫、治印、詩文均為世所重，有《留春草堂詩鈔》等刊行。他尤善書法，時有“南伊北鄧”(伊秉綬、鄧石如)之譽，為清代著名書法家。他字工四體，行書、篆體均精。所作隸書，舉世叫絕，其體貌鮮明，用筆圓渾，近于繆篆，橫平豎直，不喜作波挑燕尾，即便作，亦意到即止，而結體則在方正之中，巧作疏密聚散變化，長短方圓，敢于揚抑。故布白寬博，氣韻生動，雍容高雅，痛快自然，為隸書開一新生面。作匾額、楹聯，更尤縱橫排□氣象萬千，懸掛壁間，異常壯觀。何紹基謂其“八分出篆”，梁章鉅謂其“能拓漢隸而大之，愈大愈壯”。其章法之妙，匾額特見其能。如所作“愛日吟廬”，“日”“吟”二字合成一行；“退一步齋”，“一”字置于頂端，殆從漢印悟道而活用；“虛白”二字之貼上與特取橫勢，理亦近同。“三千余年上下古，一十七家文字奇”一聯，其字或長或扁，或大或小，或密或疏。“海內文章伯，古來經濟才”聯，筆劃曲直，變化無端，新意紛呈，動靜有節。“宋拓僅存”之四字扉頁，“宋”字之“木”縮撇捺而為兩點，“存”字空左下便于留題，而其“子”之橫，則故右展補空，一點一劃，悉具巧思。正如前人所說的“領略古法生新奇”，惟妙惟肖。